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析因试验可以在同一结构中评估多种干预。如果一种干预的效应取决于另一种干预是否存在，主效应汇总的解释就会改变。效率并不自动证明科学问题彼此完全独立。
明确问题与假设
定义针对每种干预和组合的问题。解释主效应在什么条件下代表平均比较。规划时考虑合理可能的交互作用、组合安全性和可用信息。信息不足以检出交互作用，不是交互作用确定不存在的证据，也不证明所有合并主效应解释都恰当。
假设性研究示例
在一项假设试验中，两种干预单独使用时呈现一种模式，合并使用时则呈现另一种模式。团队不会仅提供跨所有组合单元合并的单一主效应汇总，而是展示组合结果及不确定性，明确哪些假设支持计划解释，以及哪些观测可能挑战这些假设。
设计审查核查要点
- 在研究方案中分别定义针对单项干预和组合的问题。
- 展示每个析因组合单元内的受试者数量和终点可用性。
- 避免仅凭各组单独的显著性标签解释交互作用。
记录决策及其局限
经认可的报告应区分主效应、组合和交互作用评估的作用。在计划框架内处理多重性和不完整组合单元。意外模式可能产生假设，但不能事后编造新层级，就将其表述为已获前瞻性确认。临床安全决策仍应独立于统计便利，并明确报告剩余不确定性。
常见问题
- 析因设计就是两个独立研究吗？
- 并不完全是。共同结构和交互作用假设影响解释。
- 交互作用不显著就证明不存在吗？
- 不能。可用信息和精确度可能有限。